重磅丨望石智慧首发全新小分子医药早研智能体MolVortex，引领智能体进入真实研发决策

创新药物发现是一场循环往复的科学决策闭环。一次科学发现的起点，通常来源于研发人员的观察与假设，再设计候选，用合适的方法评估，决定下一步行动，进入实验，并把结果回传下一轮观察。

因此，创新药研发不能止步于单点的计算或预测。长期以来，AI工具更多扮演“AI Assistant”的角色，擅长执行指令，如整理文档、安排计划等，大多停留在“助手”层面。而药物研发需要依据研发人员分析结果、做判断，并对下一步负责。尽管AI工具能够高效完成单点任务，但其无法辅助科学家完成一次完整的决策循环。

过去，这个决策闭环完全依赖科研人员手动串联。文献、专利、结构数据、实验结果分散在不同系统和工具里，每一轮循环，科研人员都要消耗大量时间在信息整理、工具操作、数据对齐上，导致这极大地占用了他们真正用在核心科学判断上的时间和精力。

在此背景下，望石智慧以搭建能够辅助药物研发决策、开箱即用的专家级智能体为出发点，推出全新小分子医药早研智能体MolVortex。该平台以多智能体协同架构为核心，以决策罗盘为全链路数据底座，助力药物研发团队将研发目标、行动与证据组织成可持续迭代的系统，构建小分子药物研发新范式。

MolVortex是交叉学科智慧结晶。过去数年，望石智慧内部调动人工智能、计算化学、药物化学等跨学科专家联合攻坚，将药物研发真实思维链条融入产品设计，使产品紧贴真实药物研发流程与需求。

平台搭载20余个专业智能体。接到研发需求后，MolVortex作为“首席科学家”，动态组合多个可复用的专业智能体，自动集结情报智能体、分子设计智能体、结构模拟智能体等子Agent推进研发，贯通药物早期研发从药研情报收集分析、专利与文献智能解析、SAR与研发决策分析、分子生成与优化设计、亲和力与口袋分析、合成性与成药性评估全流程，让数据、模型和专家判断在同一个任务中协同合作。

期间，MolVortex能够自主完成从研发目标拆解、任务规划、多工具调度执行到结果校验交付的全流程，无需人工在不同工具和环节之间手动串联。其所输出的每一项方案都有据可依、有理可信，研发人员则根据证据链做出最终判断与决策，形成“Human-Data-in-the-Loop”闭环。

相较于通用型智能体，MolVortex更像一位拥有海量药物研发知识与Know-How的专家。

MolVortex底层融合了通用大语言模型，及望石智慧独家自研的一族模型——包括2D生成模型、多模态AI 3D分子生成大模型、基于电子密度的分子生成模型等。2022年，望石智慧在全球首次提出了基于实验电子密度的3D分子生成技术，并完成技术转化落地。其中，作为望石智慧分子生成主力模型，Lingo3DMol在与同类模型头对头的比较中，在活性分子复现率、分子-口袋结合打分、分子构象等关键指标上表现优于其他模型。

此外，实验电子云以真实电子云分布为训练信号，直接反映化学键、氢键、π-π 堆积等相互作用的物理本质，让望石智慧生成的分子能够从底层贴近物理真实，这一技术底座造就了MolVortex高效、精准的分子生成能力。

此前，基于Lingo3DMol开发的AI 3D分子生成平台MolVado已在数百个真实研发项目中沉淀海量Know-How，成为国内众多小分子药物研发企业和机构首选的AI制药平台。

目前，平台已接入近百个专业数据库，包含化学与药物、生物与基因组、疾病与临床、专利与监管及通用开源数据库。此外，依托望石智慧私有数据库，MolVortex还纳入了千万量级分子活性数据及复合物数据。

同时，MolVortex具备高度的灵活性和泛化能力，可以适配多种主流大模型，组合形成“意图理解+科学决策”的能力。其中，大模型负责理解研发意图，并将其翻译为专业模型可执行的指令，传达给专有模型；望石智慧专有模型负责分子生成与计算推演，完成完整早期研发链条的闭环。

针对AI“黑箱”带来的决策信任难题，MolVortex首创“决策罗盘”作为研发决策中枢。决策罗盘可以将药物早期研发全流程的所有节点数据、证据来源、实验结果、项目状态等自动沉淀为可追溯的研发证据与决策依据，且具备永久记忆能力。

通常来说，从情报检索、分子设计、结构模拟到成药性评估，药物研发各环节所面临的数据模态均不相同。MolVortex能够匹配各模态的数据格式，并无缝在线编辑，形成可交互的科学产物。

例如，在情报分析环节，MolVortex可以识别专利文献等文字内容，提取化合物结构等分子结构信息，在此基础上，数据流转至分子设计环节，研发人员可以继续在3D口袋上编辑口袋边界、定义相互作用位点、修改分子片段，这些编辑动作会被系统记录，并融入后续的推理与任务执行。当研发人员回传湿实验数据至MolVortex，平台能够在解析后，沉淀完整数据，反哺模型，加速自进化。

对于研发科学家而言，基于完整证据链，其能够对不同研发方案实现多维度评估与优先级排序，加速判断下一步最优行动（Next Best Action），使决策更快推进目标；对于药物研发企业，决策罗盘能够为企业沉淀更多的认知资产和数据资产，助力私有数据库搭建。研发团队无需再在不同部门、不同系统之间来回同步信息、核对数据，通过决策罗盘就能获得全链路的统一决策视图。

此次MolVortex的推出，更代表着望石智慧对于未来研发范式趋势的预判。未来，以MolVortex为代表智能体将从研发工具延伸到研发方式：更高质的分子，让每一轮设计更接近目标；更专注的科学家，把时间还给判断与创意；更敏捷的团队，让组织由智能体赋能，推动更高效能的团队。

对于药物研发而言，MolVortex推动了评价标准的升级。研发团队不再只聚焦单个模型的精度指标，而是回归真实研发的核心维度。决策质量、样本效率、循环效率、目标达成度，最终指向一个目标：用更少的实验、更少的周期，推进到更好的分子。

对于研发团队而言，MolVortex为药化科研团队配备了更智能的外脑和一支自动化执行团队。药化专家无需精通复杂专业软件，可以通过语音语音直接调用原本需要跨部门协作的计算化学能力。

根据望石智慧内部评测结果，MolVortex能够在十几分钟内完成专利的活性数据提取、权利要求保护范围解析、上百分子的 SAR 构效分析与结合模式评估等跨部门重负荷工作。相比传统多个工具拼接流程，基于MolVortex进行分子设计，能够在1小时内批量获得数百个结构新颖、高质量化合物，效率相较传统模式提升70%。从高质量HIT（苗头化合物）发现到PCC（临床前化合物）的整体推进速度最高缩短约90%。

对于组织而言，MolVortex所代表的研发新范式，将有望推动制药企业组织进化与革新。原有模式下药化、CADD、IT 之间层层传递需求的链条被打破，研发团队从“按职能分工”转变为“按任务协同”，围绕同一个研发任务与最终产出协同，组织不必再为层层传递配置中间岗位，管理和团队搭建成本随之下降。

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